要保证一库清水往北流，有许多问题亟待加以解决，尽管相关部门采取了一些治理措施，但面临的难度仍不小。除此之外，还有一些问题也应引起重视。

    一是水质监管能力薄弱，监测能力建设滞后。记者在南阳市环保部门了解到，目前南阳市尚不具备水源地全因子监测手段，集中式生活饮用水水源地必测的109项污染因子，目前只能监测29个常规因子。即将成立的南阳丹江口水库监测站，由于规划批复的项目建设资金至今还没有到位，致使目前站房尚未建设，设备尚未到位，暂不具备监测条件。而丹江口水库汇水区域内的县级环境监测站，也都存在设备落后、仪器不配套等诸多问题，直接影响到水质监测工作的开展。

    二是丹江口汇水区域3省之间缺乏有效沟通的机制。丹江口水库流域分属3省，湖北、陕西为上游水域，而河南南阳为下游。上游省市企业、畜牧、农业、渔业、生产生活等方面的污染直接影响到下游的丹江口水库水质。据了解，汉江上游两岸企业繁多，前不久央视报道的汉江污染事件，直接影响到下游南阳丹江口水库库区。由于3省之间缺乏有效的沟通联系机制，导致重要环境信息交流不畅，影响了环境事故预防的有效性。

    三是相关部门的协调配合仍存在差距。中央和地方的各职能部门应加大协调配合，通过联合督查、联合整治等方式，调动一切可以协调的力量，来开展南水北调中线工程水源地环境综合整治工作，并建立健全工业污染防治和监管、航运船舶污染防治、农业面源污染防治控制、区域水环境污染防治等联防联控、应急预案长效机制，才能有效预防和解决丹江口水库库区存在的环境问题。